2003年上海交通大学与法国马赛商学院合作开设工商管理硕士（MBA）课程，法国KEDGE商学院成立于1872年，也是法国十大精英商学院之一，项目颁发外方管理学硕士学位，每年招生规模为50人。
交大-莫航项目于2019年获教育部批准为中外合作办学项目，旨在为我国及“一带一路”沿线国家培养具有国际视野、厚基础、重实践的航空航天领域未来精英，采用双学位培养模式和国际化教学体系，每年计划内招生规模40人，学制2.5年，中俄学生同班授课，符合要求的毕业学生颁发交大和莫航双硕士学位。
2018年与新加坡国立大学合作举办，集中两所高校在量化金融、金融数学、统计学、数据科学等方向最顶尖的学术力量和师资力量，旨在培养具有国际化视野、全面掌握数量金融理论基础、通晓金融实务运作的高级复合型专业人才。项目发放外方数量金融硕士学位，每年自主招生规模为30人。
2002年上海交通大学与新加坡南洋理工大学商学院合作开设高级管理人员工商管理硕士（EMBA）课程，颁发外方管理学硕士学位，每年自主招生规模为50人。全球移动课堂是课程的一大特色，办学课程多元化、国际化、独树一帜而又严谨创新。
2012年由上海交通大学和英国曼彻斯特大学商学院合作举办，项目旨在培养兼具卓越领导力和科研精神的高层次国际化管理人才，每期招生规模为25人，颁发外方工商管理博士学位证书（招生有效期已于2018年截止）。
本项目2013年9月获教育部批准，为国内首个医学博士中外合作办学项目，每年计划内招生计划为30人，学制为8年，项目借鉴法国先进的教学理念和教学模式，大胆实践和创新，旨在培养基础知识广博、临床能力扎实，具备国际化视野和科研能力的复合性人才。
2002年上海交通大学与加拿大不列颠哥伦比亚大学尚德商学院共同合作，开设国际工商管理硕士（IMBA）课程，不列颠哥伦比亚大学名列世界大学排名前30，其尚德商学院在北美商学院中名列前茅，项目颁发外方管理学硕士学位，每年招生规模为50人。
2015年上海交通大学医学院与渥太华大学医学院合作举办的临床医学本科项目获教育部批准，项目学制5年，每年计划内招收规模为60人，项目对接上海市综合教育改革的重大战略，完善适应国际化背景的现代卓越医学创新人才教育模式，构建中外医学教育合作办学的新模式。
2021年，上海市教育委员会、上海市崇明区人民政府和上海交通大学战略框架合作协议，共同建设上海交通大学国际农业与生态学院。学院将依托上海交通大学和以色列耶路撒冷希伯来大学的优势教育资源，根据全球可持续发展、粮食安全和人类卫生健康共同体需求，整合全球资源，组合创新课程培养方案的设计，建设全球生态、农业、食品及相关研究领域专家、教授和学者数据库，引入优质的教学师资力量，提供相关领域的综合性教育，致力于培养现代农业、人类营养健康和生态环境的国际化创新人才。
国际化是交大与生俱来的特质，是流淌在交大人血液中的品格和特性。多年来，学校坚持“以开放促改革、以改革促发展”，积极推进国际化发展。
为进一步贯彻习总书记在中共中央政治局就加强我国国际传播能力建设进行第三十次集体学习中的讲话精神，讲好中国故事，传播好中国声音，展示真实、立体、全面的中国， 我校组织开展第002期管理人员国际化能力培训，以期增强我校管理人员的制度自信、文化自信，提高讲好中国故事，传播中国声音的能力。
为打造一支具有家国情怀、支撑和推动我校的教育对外开放进程、通晓国际教育惯例与规律、理解国内外形势与学校国际化政策、拥有国际化理念与视野、具备国际交流能力的高素质管理和服务队伍，国际合作与交流处将举办上海交大第03期管理人员国际化能力提升培训。